SRAS-CoV-2 : Avis complémentaire concernant la durée de contagiosité chez les cas confirmés de COVID-19 du variant Omicron dans les milieux de soins

Ce document est basé sur la littérature disponible concernant le variant Omicron et peut changer selon l’évolution des connaissances. Les recommandations sont fondées sur l’information disponible au moment où elles ont été élaborées.

Cet avis doit être utilisé de façon complémentaire aux documents produits par le CINQ disponibles sur la page Prévention et contrôle des infections de l’INSPQ.

L’émergence du variant Omicron dans les milieux de soins apporte de nombreux questionnements concernant les mesures de prévention et contrôle des infections, particulièrement concernant la période d’isolement ainsi que la durée de contagiosité. Certaines instances internationales, telles que les Centers for Disease Control (CDC) (2021a, 2021b) et Swissnoso (2021) ont recommandé de diminuer la durée d’isolement chez les cas confirmés de COVID-19 dans la communauté et chez les travailleurs de la santé (TdeS) en situation ou non de pénurie de personnel. Cependant, ces différents avis ne réfèrent à aucun article ou revue scientifique.

Il existe à l’heure actuelle peu de littérature scientifique sur la durée de contagiosité du variant Omicron. Certaines études utilisent la culture virale, d’autres le TAAN et finalement certains ont plutôt interprété le nombre de cycles thermiques (CT) pour estimer la contagiosité des personnes infectées. Les études qui incluent la culture virale permettent mieux d’évaluer la durée de contagiosité par le SRAS-CoV-2. À ce jour, une seule étude inclut la culture virale dans ses analyses avec le variant Omicron. Également, aucune littérature n’est disponible concernant la contagiosité chez les personnes âgées et les personnes immunosupprimées. Quelques études semblent cependant indiquer une durée de contagiosité similaire à celui des variants précédents.

Résumé de la littérature scientifique disponible

Selon une étude japonaise (National Institute of Infectious Disease, 2022), la quantité d’ARN viral mesurée est à son pic 3-6 jours après le diagnostic ou l’apparition des symptômes et diminue de façon graduelle avec une chute plus importante après 10 jours. Des cultures virales effectuées chez ces cas démontrent des résultats similaires avec la présence de virus cultivable entre 7 à 9 jours et une absence de virus cultivable 10 jours après le diagnostic ou le début des symptômes. Cette étude comporte toutefois certaines limites, particulièrement la petite taille de l’échantillon (n = 21) et l’absence d’informations telles que l’âge ou l’immunosuppression des cas. Une seconde étude, celle de Puhach et al. (2022) démontre que la charge virale, chez les personnes vaccinées notamment, est similaire lors d’une infection à variant Omicron comparativement à une infection à variant Delta. Néanmoins, cette étude repose également sur une petite taille d’échantillon de cas ayant le variant Omicron (n = 18) et n’a pas fait l’objet d’une révision par les pairs. Une troisième étude, Okumura et al. (2021), a démontré encore une fois sur un petit échantillon de 11 cas, une valeur de CT qui augmente graduellement durant les 10 premiers jours et plus. Finalement, une étude de Hay et al. (2022) a démontré une durée moyenne d’excrétion virale de 9.87 jours avec le variant Omicron et de 10.9 jours avec le variant Delta. La taille d’échantillon est plus intéressante (n = 97 variant Omicron et n = 107 variant Delta), mais cette étude n’a pas été encore révisée par les pairs.

Considérant que :

  • Il existe à l’heure actuelle peu de littérature sur le variant Omicron et sa durée de contagiosité et que, jusqu’à présent, celle-ci ne met pas en évidence une durée de contagiosité différente de celle des autres variants;
  • La littérature scientifique concernant les variants antérieurs à Omicron a démontré une durée de contagiosité de 10 jours ou plus selon certaines conditions présentées dans les publications (p. ex. immunosuppression);
  • La recommandation des CDC (2021a) de diminuer la durée d’isolement pour la population chez les cas confirmés de COVID-19 à 5 jours ne citent pas de littérature scientifique en appui;
  • La recommandation des CDC (2021b) de diminuer la durée d’isolement pour les TdeS chez les cas confirmés de COVID-19 à 5 jours ou moins est recommandé seulement lors d’un plan de contingence;
  • La présence en milieux de soins et de vie de personnes dont l’excrétion virale est connue pour être plus longue avec les autres variants (Longtin et al., 2021);
  • La présence en milieux de vie et de soins de personnes plus vulnérables pour la COVID-19, y compris des personnes qui répondent moins bien à la vaccination.

Le CINQ recommande :

  • De maintenir la durée d’isolement à 10 jours pour les cas confirmés de COVID-19 (tant pour les usagers que pour les TdeS), à l’exception des personnes avec immunosuppression ou avec maladie sévère pour qui l’isolement demeure à 21 jours.
  • Il est toutefois possible, en situation de rupture de service, que cette durée soit revue et encadrée par des directives ministérielles selon une approche de gestion de risque.
  • D’appliquer rigoureusement l’ensemble des mesures de Prévention et contrôle des infections qui visent ces milieux.

Références

SRAS-CoV-2 : Avis complémentaire concernant la durée de contagiosité chez les cas confirmés de COVID-19 du variant Omicron dans les milieux de soins
Sujet(s)
COVID-19
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