Madame, Monsieur,

La diminution du nombre de cas positifs quotidiens nous oblige à ajuster la durée de la période de collecte pour le séquençage aléatoire des échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 afin de continuer à recevoir environ 1000 échantillons par semaine au LSPQ. Ainsi, à partir du samedi 11 mars 2023, la nouvelle période de collecte sera du samedi 0 h (minuit) au mardi 12 h (midi).

Mis à part ce changement au niveau de la période de collecte, le processus reste identique. Nous souhaitons réitérer que la réception au LSPQ des échantillons dans les plus brefs délais suivant la période de collecte demeure essentielle au bon fonctionnement du processus, particulièrement lors de la période estivale. En raison des contraintes liées à notre processus, nous ne pouvons pas garantir que les échantillons reçus après jeudi seront choisis pour le séquençage aléatoire.

Changement au niveau de la période de collecte

Nous continuons de viser le processus le plus stable possible. Toutefois, en fonction du nombre de cas positifs quotidiens, nous devrons périodiquement ajuster la durée de la période de collecte, afin de recevoir au LSPQ environ 1000 échantillons par semaine au total. Le cas échéant, une communication comme celle-ci vous sera envoyée environ 7 jours avant le changement.

Rappel de la marche à suivre

Échantillons positifs ayant été dépistés du samedi 0 h (minuit) au mardi 12 h (midi) (nouvelle période de collecte)

Acheminer les échantillons ayant une CT < 30 au LSPQ dans les plus brefs délais avec les formulaires PHAGE imprimés. Assurer l’arrivée des échantillons au plus tard jeudi suivant la période de collecte.

• PHAGE : Sous « Première analyse », sélectionner « Coronavirus (SARS-CoV-2) : biobanque séquençage aléatoire » et compléter les champs requis.
• Prélèvement/Spécimen : Échantillon respiratoire (1 ml). Les échantillons primaires peuvent être conservés au réfrigérateur et expédiés dans un colis contenant des sachets de glace (ice-packs) s’ils sont reçus au LSPQ moins de 72 heures après le prélèvement. Sinon, ils doivent être congelés à – 80 °C et expédiés sur glace sèche.
• Bien que le LSPQ accepte de recevoir les tubes primaires, nous avons remarqué que certains centres nous envoient une aliquote, dans ce cas voici les tubes à privilégier :

• Catégorie de transport recommandée : Catégorie B. s’il vous plait, apposer une étiquette sur la boîte indiquant « Séquençage aléatoire variants SRAS-CoV-2 » et cocher s’il y a d’autres types d’échantillons à l’intérieur de la boîte (voir exemple ci-dessous).

Échantillons positifs ayant été dépistés hors de la période de collecte

• Séquençage prioritaire (voyageurs, éclosions après entente et situations particulières après entente) : envoyer les échantillons au LSPQ selon la procédure de séquençage prioritaire.
• Tous les autres échantillons positifs : appliquer le processus local de disposition des échantillons.

Pour de plus amples informations, nous vous invitons à contacter monsieur Sorin Busuioc ([email protected]), conseiller-cadre au LSPQ.

En vous remerciant de votre collaboration habituelle,

Judith Fafard, M.D., FRCPC
Directrice médicale
Laboratoire de Santé publique du Québec

Florence Lacasse, T.M., MBA
Directrice des opérations
Laboratoire de santé publique du Québec

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Chers collègues,

Nous sollicitons à nouveau votre participation au programme de surveillance provincial des souches de N. gonorrhoeae. Ce programme vise tous les laboratoires de la province. Nous vous demandons donc de nous faire parvenir toutes les souches de N. gonorrhoeae isolées de votre centre, et ce, peu importe le site et la date de prélèvement.

Afin d’assurer une meilleure viabilité, les souches doivent être envoyées de préférence sous la forme d’un congelé et expédiées sur glace sèche. Les souches peuvent aussi être expédiées à la température ambiante sur une gélose en pente. Le test suivant doit être sélectionné sur la requête PHAGE : «Neisseria gonorrhoeae: programme de surveillance». Pour plus de détails consulter le guide de service.

L’antibiogramme doit être réalisé dans votre laboratoire. Nous sommes conscients que certains laboratoires qui réalisent la culture acheminent la souche à un laboratoire serveur pour antibiogramme. Le laboratoire ayant la responsabilité de transmettre la souche et l’antibiogramme au LSPQ est celui ayant réalisé la culture. Votre rapport d’antibiogramme devra accompagner les souches lors de l’envoi. L’antibiogramme peut être joint à la requête ou les résultats d’antibiogramme peuvent être indiqués dans le champ « Autres données pertinentes » de la requête PHAGE (https://www.inspq.qc.ca/formulaire-sgil/).

Le formulaire ci-joint doit être utilisé pour la compilation de vos données pour l’année 2023. Si ce n’est pas déjà fait, nous vous rappelons que les données de l’année 2022 doivent nous être acheminées au plus tard le 31 mars 2023.

Pour toute question concernant votre participation à ce programme, nous vous prions d’acheminer un courriel à l’adresse suivante : [email protected]

Nous profitons aussi de ce communiqué pour vous rappeler que nous surveillons l’émergence de souches non sensible à la céfixime au Québec. Il s’avère donc important de suivre les directives indiquées dans notre lettre annonce diffusée le 3 août 2020: « Marche à suivre dans un contexte d’émergence des souches de Neisseria gonorrhoeae non sensibles à la céfixime ».

Dans ce contexte, nous sollicitons votre collaboration afin que vous puissiez acheminer rapidement au LSPQ les souches de N. gonorrhoeae. Afin d’accélérer le processus, lorsqu’une souche possédant une CMI à la céfixime ou à la ceftriaxone ≥ 0,12 mg/L, la transmettre dès que possible au LSPQ et aviser Brigitte Lefebvre au 514-457-2070, poste 2334.

Afin de soutenir les cliniciens pour une prise en charge adéquate, ainsi que les directions de santé publique pour une intervention appropriée, nous vous rappelons que :

1. Les antibiotiques à tester incluent notamment la céfixime, la ceftriaxone, l’azithromycine et la ciprofloxacine, comme recommandé dans le guide « Détection de Neisseria gonorrhoeae par culture » du CALI ainsi que dans le cadre normatif de l’INSPQ. ^1,2
2. La céfixime, la ceftriaxone et l’azithromycine doivent être testés par la méthode de diffusion en gradient (E-test) afin d’obtenir une CMI en mg/L.
3. L’antibiogramme transmis au clinicien doit inclure tous les antibiotiques testés, peu importe le site d’infection.
4. Tous les résultats de l’antibiogramme doivent être transmis dès que disponibles à la direction de santé publique, et ce malgré que la souche soit acheminée au LSPQ dans le cadre du programme de surveillance.
5. Aviser le clinicien ainsi que la direction de santé publique lorsqu’une CMI ≥ 0,12 mg/L est obtenue pour la céfixime ou la ceftriaxone, en indiquant le message suivant à votre rapport d’analyse :
   • Un test de contrôle est toujours recommandé suite au traitement d’une infection gonococcique; si la ceftriaxone n’a pas été utilisée pour le traitement, la réalisation d’un test de contrôle est particulièrement importante. ³
   • Pour le traitement, suivre les recommandations du guide d’usage optimal.^3,4
   • Souche acheminée au Laboratoire de santé publique du Québec (LSPQ) pour confirmation.

Nous comptons sur vous pour transmettre ces informations au personnel de votre département. Veuillez nous aviser de tout changement concernant la personne-ressource de votre établissement qui est responsable de ce programme.

Nous vous remercions de votre précieuse collaboration.

Judith Fafard, M.D., FRCPC
Directrice médicale
Laboratoire de Santé publique du Québec

Brigitte Lefebvre, Ph.D
Spécialiste clinique en biologie médicale
Laboratoire de Santé publique du Québec

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Madame, Monsieur,

Nous désirons vous informer qu’il y aura interruption de service au Laboratoire national de microbiologie (LNM) à Winnipeg pour les analyses des hépatites virales pour au moins 2 semaines, soit du 30 janvier au 13 février 2023.

Pour le Québec, les analyses touchées sont la sérologie de l’hépatite E (et plus rarement le génotypage) et la détection qualitative et quantitative de l’ARN de du virus de l’hépatite D.

Pendant cette période, vous pouvez continuer à nous faire parvenir les échantillons pour analyse. Ceux-ci seront acheminés congelés du LSPQ au LNM comme à l’habitude. Toutefois, ils seront traités dès que le LNM sera en mesure de reprendre les analyses.

Ceci est dû au déménagement du Laboratoire des agents pathogènes à diffusion hématogène et des hépatites virales. Il passe du Centre scientifique canadien de santé humaine et animale au Centre de recherche sur les maladies infectieuses JC-Wilt.

Urgence

Pour un diagnostic urgent d’hépatite E, nous vous invitons à communiquer avec le CHU-Sainte-Justine qui offre la détection quantitative (charge virale) de l’ARN du virus de l’hépatite E.

Nous vous informerons de tout changement ou si une prolongation s’avère nécessaire.

Pour toute information complémentaire, nous vous invitons à contacter Donald Murphy par courriel ([email protected]) ou téléphone au (514) 457-2070 poste 2266.

En vous remerciant de votre collaboration habituelle,

Judith Fafard, M.D., FRCPC
Directrice médicale
Laboratoire de Santé publique du Québec

Donald Murphy, Ph.D
Spécialiste clinique en biologie médicale
Responsable des hépatites virales
Laboratoire de santé publique du Québec 

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Madame, Monsieur,

Avec la recrudescence des infections respiratoires, une résurgence de certaines infections bactériennes invasives est à anticiper.  Voici quelques rappels en lien avec ce phénomène.

• Les laboratoires isolant des Streptococcus pyogenes (SGA) de sites stériles ou d’infections invasives doivent les déclarer à la direction de la santé publique régionale correspondante via le formulaire MADO et acheminer l’isolat au LSPQ pour typage.
• Les infections invasives à Haemophilus influenzae et Neisseria meningitidis sont également des MADO et les isolats doivent être acheminés au LSPQ pour typage. Il est possible d’effectuer le typage à partir de l’échantillon clinique dans le cas d’une culture négative. Dans le but de capter tous les cas invasifs d’Haemophilus influenzae et de Neisseria meningitidis afin de soutenir le programme d’immunisation québécois, veuillez référer systématiquement au LSPQ tous liquides biologiques normalement stériles positifs par TAAN pour H. influenzae ou N. meningitidis dont la culture est négative. Ces échantillons seront référés au LNM pour détermination du sérotype ou sérogroupe par TAAN.

Si des échantillons prélevés en 2022 sont encore disponibles dans vos laboratoires, prière de nous les acheminer.

Le spécimen de choix pour une analyse optimale nécessite minimalement 200 microlitres (μL) du spécimen primaire (liquide biologique normalement stérile). Pour les prélèvements sanguins, utiliser des tubes avec EDTA. L’extrait d’ADN peut être envoyé, mais offre un taux de succès moindre. Les échantillons doivent être conservés à -70°C et expédiés congelés sur glace sèche.

Sur la requête PHAGE, veuillez sélectionner l’analyse :

• « Haemophilus influenzae : détection (TAAN) sur spécimen primaire »

Ou

• « Neisseria meningitidis : détection (TAAN) sur spécimen primaire »

Et préciser :

• Le type de spécimen (échantillon clinique ou extrait d’ADN)
• La nature du prélèvement
• Valeur de Ct et Cp obtenue au TAAN ou spécimen positif au BioFire

Pour toute information complémentaire, veuillez consulter le répertoire des analyses du LSPQ :

• Neisseria meningitidis (identification et sérogroupage par TAAN)
• Haemophilus influenzae (détection d'acides nucléiques) 
• Streptococcus pyogenes (génotypage)

Nous vous rappelons que tous les liquides stériles positifs pour Streptococcus pneumoniae dont la culture est négative doivent également être acheminés au LSPQ pour sérotypage : Streptococcus pneumoniae (détection d'acides nucléiques) . Voir les détails dans la précédente lettre annonce. Les infections invasives à S. pneumoniae sont également des MADO.

Pour N. meningitidis, H. influenzae, S.pyogenes et S. pneumoniae, prendre note que si une culture est disponible isolée de site normalement stérile, il est important de nous l’acheminer dans le cadre de la surveillance provinciale. Dans ce cas, il n’est pas requis de nous acheminer le spécimen primaire positif par TAAN. Voir Microorganismes et spécimens à être acheminés au LSPQ dans le cadre de programmes de surveillance.

Une augmentation des cas de S.pyogenes a été observé chez les enfants. Pour tout envoi concernant les cas de < 18 ans, veuillez apposer le numéro d’éclosion OB22-009 lors de la création de la requête afin que nous puissions en prioriser le traitement.

Dans le cas d’une demande urgente de sérotypage ou sérogroupage pour N. meningitidis, H. influenzae ou S. pneumoniae, veuillez aviser madame Brigitte Lefebvre par courriel ([email protected]) ou téléphone au (514) 457-2070 poste 2334.

En vous remerciant de votre collaboration habituelle, veuillez recevoir nos meilleures salutations.

Judith Fafard, M.D., FRCPC
Directrice médicale

Brigitte Lefebvre, Ph. D.
Spécialiste clinique en biologie médicale

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Madame, Monsieur,

Nous désirons vous informer que le séquençage aléatoire des échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 sera maintenu durant les deux semaines de la période des fêtes. Nous souhaitons réitérer que la réception au LSPQ des échantillons dans les plus brefs délais suivant la période de collecte demeure essentielle au bon fonctionnement du processus, particulièrement lors de la période des fêtes. En raison des contraintes liées à notre processus, nous ne pouvons pas garantir que les échantillons reçus après jeudi seront sélectionnés pour le séquençage représentatif.

Période de collecte

Le processus reste identique; la période de collecte demeure du lundi 0h (minuit) au mardi 12h (midi). Nous continuons de viser le processus le plus stable possible. Toutefois, en fonction du nombre de cas positifs quotidiens, nous devrons périodiquement ajuster la durée de la période de collecte, afin de recevoir au LSPQ environ 1000 échantillons par semaine au total. Le cas échéant, une communication comme celle-ci vous sera envoyée environ 7 jours avant le changement.

Rappel de la marche à suivre

Échantillons positifs ayant été dépistés du lundi 0 h (minuit) au mardi 12 h (midi) (période de collecte actuellement en vigueur)

Acheminer les échantillons ayant une CT < 30 au LSPQ dans les plus brefs délais avec les formulaires PHAGE imprimés. Assurer l’arrivée des échantillons au plus tard jeudi suivant la période de collecte.

• PHAGE : Sous « Première analyse », sélectionner « Coronavirus (SARS-CoV-2) : biobanque séquençage aléatoire » et compléter les champs requis.
• Prélèvement/Spécimen : Échantillon respiratoire (1 ml). Les échantillons primaires peuvent être conservés au réfrigérateur et expédiés dans un colis contenant des sachets de glace (ice-packs) s’ils sont reçus au LSPQ moins de 72 heures après le prélèvement. Sinon, ils doivent être congelés à – 80 °C et expédiés sur glace sèche.
• Bien que le LSPQ accepte de recevoir les tubes primaires, nous avons remarqué que certains centres nous envoient une aliquote, dans ce cas voici les tubes à privilégier :

• Catégorie de transport recommandée : Catégorie B. s’il vous plait, apposer une étiquette sur la boîte indiquant « Séquençage aléatoire variants SRAS-CoV-2 » et cocher s’il y a d’autres types d’échantillons à l’intérieur de la boîte (voir exemple ci-dessous).

Échantillons positifs ayant été dépistés hors de la période de collecte

• Séquençage prioritaire (voyageurs, éclosions après entente et situations particulières après entente) : envoyer les échantillons au LSPQ selon la procédure de séquençage prioritaire.
• Tous les autres échantillons positifs : appliquer le processus local de disposition des échantillons.

Pour de plus amples informations, nous vous invitons à contacter monsieur Sorin Busuioc ([email protected]), conseiller-cadre au LSPQ.

En vous remerciant de votre collaboration habituelle,

Judith Fafard, M.D., FRCPC
Directrice médicale
Laboratoire de Santé publique du Québec

Florence Lacasse, T.M., MBA
Directrice des opérations
Laboratoire de santé publique du Québec

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Modification de l’horaire des analyses de détection de la variole simienne au LSPQ

Agrégat de souches de Salmonella multi-résistantes

Demande de spécimens cliniques pour la surveillance de l'influenza au début de la saison 2022-2023

Circulation de poliovirus vaccinal dans l’État de New York : correction des instructions d'envoi et de l'horaire de la fin de semaine de la fête du travail.