Veille scientifique COVID-19
Deux veilles signalétiques en lien avec la COVID-19 sont envoyées par l’INSPQ.
La veille scientifique COVID-19 est la plus générale. Envoyée quotidiennement, elle recense les publications et prépublications scientifiques en lien avec la prévention, le contrôle, la clinique et l’épidémiologie de la COVID-19. Elle vise à soutenir les travaux et la prise de décision en offrant un accès accéléré aux nouvelles connaissances sur la COVID-19 aux intervenants, aux acteurs et décideurs de santé publique. Les nouvelles publications et prépublications scientifiques retenues sont regroupées en thématiques.
La veille COVID-19 et santé environnementale, envoyée une fois par semaine, recense des publications et prépublications scientifiques et la littérature grise touchant la COVID-19 et des sujets comme l’air, l’eau, les conditions météorologiques ou environnementales, la viabilité du virus et les modes de transmission.
Présentation générale
Un processus de veille non exhaustive de la littérature scientifique est mené en continu. Les résultats provenant d’un ensemble de sources pertinentes sont captés par un agrégateur de flux RSS puis triés quotidiennement par une équipe formée de conseillères scientifiques et d’un médecin conseil. Les publications et prépublications retenues sont ensuite classées dans différentes thématiques.
La littérature grise est également sélectionnée pour la veille touchant la santé environnementale.
Thématiques de la veille scientifique COVID-19
- CHSLD – RPA : éclosions, modes de transmission, gestion des personnes exposées, mesures de prévention et de contrôle des infections, impacts de la vaccination sur ces mesures, etc.
- Clinique : présentation clinique et durée de la maladie, symptômes persistants, complications, prédicateurs et facteurs de risque de sévérité, réinfection/réactivation, co-infections, etc.
- Enfants – Femmes enceintes : susceptibilité d’acquérir la COVID-19 par cette population, potentiel de transmission (mère-enfant, enfant-enfant, enfant-adulte), présence des anticorps neutralisants dans le lait maternel, etc.
- Épidémiologie : méthodes de surveillance, modélisation de la pandémie, effets des conditions météorologiques et de la pollution sur la prévalence et la transmission de la maladie, populations à risque, etc.
- GCC – Communauté : gestion des cas et des contacts en milieu communautaire (milieux scolaires, camps de jour, contacts domiciliaires, milieux extérieurs, milieux de travail excluants de soins, etc.) : modes de transmission, éclosions, méthodes de traçage des contacts, asymptomatiques, impacts de la vaccination sur la transmission, etc.
- Laboratoire : tests diagnostic et comparaison des méthodes, types d’échantillonnage, prévalence des faux négatifs.
- Mesures populationnelles : port de masques et de couvre-visages par la population générale, mesures de confinement, déconfinement/reconfinement, couvre-feu, distanciation physique, etc.
- PCI - milieux dentaires : mesures de prévention et de contrôle des infections en milieux dentaires : transmission par les aérosols dentaires, production d’aérosols par les instruments, mesures barrières, équipement de protection, etc.
- PCI – milieux de soins : mesures de prévention et de contrôle des infections en milieux de soins : prise en charge des travailleurs et usagers exposés, durée et levée de l’isolement, impacts de la vaccination sur les mesures PCI, équipement de protection individuelle, retraitement d’équipement à usage unique, procédure de désinfection, etc.
- Santé au travail : éclosions en milieux professionnels, modes de transmission, mesures de prévention et de contrôle des infections.
- Séroprévalence : prévalence et durée des anticorps neutralisants après infection ou en post-vaccination.
- Traitement : traitement et prise en charge de la COVID-19.
- Vaccination : effets de la vaccination, mesures sanitaires pour les vaccinés, mesures de protection individuelle, de dépistage ou de confinement qui distinguent les vaccinés des non-vaccinés, mise en place d’un passeport vaccinal, taux de couverture vaccinale à partir duquel les mesures s’assouplissent en milieux de soins et communautaires, perception de la vaccination, etc.
- Variants : association entre une ou des mutations et un avantage infectieux, ou des cas cliniques plus sévères, ou une incapacité du système immunitaire à neutraliser le virus, prévalence des variants, effet de la vaccination, etc.
Critères de sélection des articles pour les bulletins
Veille scientifique COVID-19
Parmi les articles retenus, une trentaine sont sélectionnés pour figurer dans la liste « À ne pas manquer » présente dans le bulletin.
La sélection des articles est effectuée en fonction de leur pertinence et des priorités en santé publique. En particulier, sont privilégiés :
- Les articles, lettres scientifiques ou correspondances apportant de nouvelles connaissances susceptibles d’orienter l’intervention de santé publique ou répondre à des questions d’actualité;
- Les méta-analyses, revues systématiques et revues de littérature;
- Publications et prépublications en français ou en anglais.
COVID-19 et santé environnementale
Pour ce bulletin, les sujets suivants sont sélectionnés :
- l’air (p. ex., polluants atmosphériques, ventilation);
- l’eau (p. ex., surveillance des eaux usées, eaux récréatives);
- les conditions météorologiques ou environnementales (p. ex., température, humidité);
- la désinfection;
- la viabilité du virus (p. ex., distance parcourue, temps de survie); et
- les modes de transmission du virus (p. ex., aérosols, surfaces).
Collecte d'information
L’agrégateur de flux RSS Inoreader est utilisé pour collecter de manière automatique et en continu les nouvelles publications et prépublications provenant des sources d’information énumérées à la section « Liste des sources », ci-bas. Des outils tels que FetchRSS, Wachete, etc. sont aussi utilisés pour les sources d’informations qui ne diffusent pas de flux RSS.
Les résultats de certaines sources sont d’abord filtrés à l’aide d’Inoreader avant d’être triés. Les résultats de certaines sources sont également dédoublonnés en partie de manière automatique par Inoreader et en partie par une intervention quotidienne de l’équipe de la documentation.
Les filtres et stratégies de recherche utilisés dans le cadre de la veille scientifique COVID-19 sont disponibles sur demande à l’adresse [email protected]
Sources pour la veille scientifique générale
L’essentiel des sources de la veille scientifique sur la COVID-19 est constitué de bases de données de publications et de prépublications scientifiques. S’y ajoute un ensemble de périodiques scientifiques, d’éditeurs scientifiques et de sites web d’organisations diffusant des informations d’intérêts en lien avec la COVID-19. Ces sources supplémentaires sont suivies pour différentes raisons : parce que leurs publications ne sont pas indexées par les bases de données suivies, parce qu’elles diffusent les publications plus rapidement (que les bases de données), etc.
Bases de données
- Pubmed
- EMBASE (Ovid)
- MedRxix
- BioRxiv
Revues/éditeurs scientifiques
- Anesthesia & Analgesia
- Annals of Work Exposures and Health
- British Medical Journal (BMJ)
- BMJ Open
- Canadian Journal of Anesthesia
- Canadian Medical Association Journal (CMAJ)
- BMJ Case report
- BMJ Global Health
- CDC - Morbidity and Mortality Weekly Report
- Cell
- China CDC Weekly
- CIDRAP - All News
- Clinical Infectious Diseases
- CMAJ Open
- Cochrane Database of Systematic Reviews
- Emerging Infectious Diseases – CDC
- European Journal of Obstetrics & Gynecology and Reproductive Biology
- Eurosurveillance
- Experimental Biology and Medicine
- Global Public Health
- Infection Control and Hospital Epidemiology
- International Journal of Infectious Diseases
- JAMA Internal Medecine
- JAMA Online First
- Journal of Clinical Investigation
- Journal of Clinical Medicine
- Journal of Engineered Fibers and Fabrics
- Journal of Epidemiology and Community Health
- Journal of Hospital Infection
- Journal of Medical Virology
- Journal of Occupational and Environmental Hygiene
- Journal of Pediatrics
- Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society
- Journal of Travel Medicine
- Nature
- Nature Communications
- NICE Guidance and Advice List
- Pediatrics
- Photodermatology, Photoimmunology & Photomedicine
- Preprints with The Lancet
- PLOS Medicine
- PLOS ONE
- Proceedings of the National Academy of Sciences
- Relevé des maladies transmissibles au Canada (RMTC)
- Revue d’Épidémiologie et de Santé Publique
- Science
- Science China Life Sciences
- Science of the Total Environment
- Scientific Reports – Nature
- The Lancet - Coronavirus
- The New England Journal of Medicine
Sources pour la veille santé environnementale
Le bulletin de veille scientifique COVID-19 est l'une des sources, en plus de celles qui suivent.
Surveillance de la littérature grise
- Affaires autochtones et du Nord du Canada, AIHW, ANSES, APHA, ASPC, ASPC, ASPQ, Assemblée nationale du Québec, Australie - ministère de la santé, CADTH, CCNDS, CCNMI, CCNMO [revues rapides], CCNPPS, CCNSA, CCNSE, CDC, CDR, CRESP, CSMC [Commission de la santé mentale du Canada], Données Québec, ECDC, Environmental Scans, Eurosurveillance, gouvernement de l’Alberta, gouvernement de l’Île-du-Prince-Édouard, gouvernement de l’Ontario, gouvernement de la Colombie-Britannique, gouvernement de Terre-Neuve, gouvernement du Canada : Conseils et avertissements par pays, gouvernement du Manitoba, gouvernement du NB, gouvernement du Québec - communiqués de presse, gouvernement du Yukon, Haut Conseil de la Santé publique [France], INESSS, INRA, Inserm, IRSST, JHSPH l covid-19 daily roundup, MAPAQ, McMaster Health, MÉSI, MMWR, MSSS, National Academy of Medicine, National Traumatic Stress Network, New York State Departement of Health, NICE, NIH, NLM, NWS Health (Australie), NYAM, OECD, OMS-WHO, Ontario Public Health Association, PAHO, Parlement fédéral (Canada), PHE, PHO, SafetyLit, Santé Canada, SCOPH Santé publique, UNSCN, Vermont department of Health).
Recherche sur les enjeux plus spécifiques à la santé environnementale
- ASHRAE
- CDC- Environnemental- cleaning COVID
- CDC-Water – COVID-19, EPA – Coronavirus, EPA – Water COVID-19, Mediatique – COVID- DSET, NCCEH- blogue, REHVA – Nouvelles, Waterrf- COVID-19, WHO – Water sanitation COVID-19;
- Pour la veille signalétique institutionnelle sur la littérature grise
- Gouvernement du Québec (Québec.ca)
- Ministère de la Santé et des Services sociaux (MSSS)
- Ministère de la Famille (MFA)
- Ministère des Affaires municipales et de l’Habitation (MAMH)
- Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec (MAPAQ)
- Ministère de la Sécurité publique (MSP)
- Réseau de la santé et des services sociaux et organismes-conseils du MSSS
- Direction régionale de santé publique de Montréal (DRSP de Montréal)
- Commission des normes, de l’équité, de la santé et de la sécurité du travail (CNESST)
- Institut national d’excellence en santé et en services sociaux (INESSS)
- Agence de santé publique du Canada (ASPC) (les nouveautés retransmises du site web de l’ASPC relèvent
- Régulièrement d’autres ministères tels que Santé Canada ou le ministère des Finances)
- Statistique Canada [depuis le 11 mai 2020]
- Public Health Ontario (PHO)
- Alberta Health Services (AHS)
- BC Centre for Disease Control (BCCDC) [depuis le 15 mai 2020]
- Centre de collaboration nationale en santé environnementale (CCNSE) [depuis le 13 mai 2020]
- Canadian Agency for Drugs and Technologies in Health (CADTH) [depuis le 13 mai 2020]
- Organisation mondiale de la santé (OMS) ;
- European centre for disease prevention and control (ECDC);
- Public Health England (PHE);
- National Institute for health and care excellence (NICE);
- Royal College of Obstetricians and Gynaecologists (RCOG);
- Royal College of Psychiatrists (RCP);
- Santé publique France (SPF) ;
- Haut Conseil de la Santé publique (HCSP) ;
- Haute autorité de santé (HAS) ;
- National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine (NASEM) [depuis le 14 avril 2020];
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC);
- Food & Drug Administration (FDA) ;
- Joanna Briggs Institute (JBI) [depuis le 13 mai 2020];
- Norwegian Institute of Public Health (NIPH) [depuis le 13 mai 2020];
- Centre for Evidence-Based Medicine (CEBM) [depuis le 13 mai 2020];
Abonnement
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