Le TAAN est beaucoup plus sensible que la culture. Il est donc prévisible d'avoir un résultat de TAAN positif et une culture négative. Par contre, on ne peut exclure un TAAN dont le résultat est faussement positif. Pour évaluer la probabilité d'un résultat TAAN faussement positif, il faudra tenir compte du contexte dans lequel le prélèvement a été fait et du site de prélèvement. Y avait-il une indication de dépister l’infection gonococcique ou seulement une indication de dépistage pour l’infection à Chlamydia trachomatis (mais détection simultanée de l’infection à Chlamydia trachomatis et de l’infection gonococcique par le laboratoire)? Est-ce que le test de contrôle a été effectué trop tôt (moins de deux semaines) après le traitement? Est-ce que le prélèvement a été fait au niveau du pharynx?
En absence d'indication de dépistage de l'infection gonococcique, un résultat faussement positif au TAAN est possible, mais avec la performance de la plupart des trousses de détection, il est raisonnable de se fier au résultat.
Le microbiologiste de votre laboratoire connaît la performance des trousses qu'il utilise et peut donc vous soutenir pour l'interprétation, particulièrement lorsque le résultat est discordant (TAAN positif et culture négative).
Une autre raison peut expliquer un résultat faussement négatif pour la culture : le gonocoque étant très sensible aux conditions de transport, si le prélèvement pour culture n’a pas été transmis au laboratoire dans les délais recommandés, on peut obtenir un résultat faussement négatif. Il est très important de respecter les consignes du laboratoire quant aux procédures pour le prélèvement, la conservation et le transport du spécimen.