Effets de la pandémie de COVID-19 sur l’utilisation communautaire d’antibiotiques en fonction des maladies chroniques
Les antibiotiques sont un outil précieux permettant de traiter les infections bactériennes.
L’exposition d’un individu à des antibiotiques entraîne progressivement une sélection de bactéries résistantes au sein de son microbiote. Celles-ci peuvent alors survivre à ces antibiotiques, réduisant leur efficacité future, dans un contexte où peu de nouveaux antibiotiques arrivent sur le marché.
Le principal déterminant de la fréquence de l’antibiorésistance dans une population est l’exposition aux antibiotiques, qu’il convient dès lors d’utiliser avec précaution. Les efforts doivent se poursuivre pour limiter leur surutilisation et améliorer leur usage.
Cette page présente les résultats et les interprétations de trois études complémentaires :
- L’impact conjoint de la pandémie et des maladies chroniques sur les taux d’utilisation des antibiotiques (en anglais);
- L’impact conjoint de la pandémie et des maladies chroniques sur la concordance avec les guides cliniques en antibiothérapie (article scientifique à paraître, en anglais);
- La corrélation entre les taux d’utilisation des antibiotiques et l’antibiorésistance dans les eaux usées (en anglais).
En réunissant les résultats de ces trois études, la présente page a pour objectif de décrire l’impact de la pandémie de COVID-19 sur l’utilisation communautaire des antibiotiques ainsi que le lien entre cette utilisation et l’antibiorésistance détectée dans les eaux usées.
Diminution importante des taux d’utilisation d’antibiotiques au début de la pandémie de COVID-19, indépendamment du nombre de maladies chroniques des individus et de leur groupe d’âge
Les mesures de prévention mises en place durant la pandémie de COVID-19 ont temporairement réduit la fréquence des autres infections respiratoires aiguës.
Malgré une hausse au retour des infections respiratoires virales habituelles, les taux d’utilisation des antibiotiques n’étaient pas encore revenus aux niveaux pré-pandémiques en mars 2022.
Les infections urinaires figurent parmi les infections les plus courantes après les infections respiratoires. L’utilisation des antibiotiques réservés à ce type d’infection – fosfomycine et nitrofurantoïne – est demeurée stable durant la pandémie, ne suggérant pas de problème d’accès aux soins lorsque nécessaire.
Figure 1 – Taux mensuel d’utilisation communautaire des antibiotiques selon le nombre de maladies chroniques et le groupe d’âge (ordonnances par 1000 individus-jours) (Québec, avril 2018 à mars 2022)
Diminution de l’utilisation des antibiotiques moins marquée chez les personnes ayant au moins 3 maladies chroniques
Chez les enfants
La baisse d’utilisation des antibiotiques chez les enfants a atteint 63 % durant la pandémie et 37 % lors du retour des virus respiratoires en post-pandémie. Cette baisse était toutefois moindre chez ceux ayant ≥ 3 maladies chroniques : 33 % et 23 % pour ces mêmes périodes, respectivement.
Chez les adultes
Similairement, l’utilisation d’antibiotiques chez les adultes a généralement diminué de 25 % en période pandémique et de 19 % à la reprise de la circulation des virus respiratoires habituels, mais ces diminutions étaient limitées à 13 % et 7 % en présence d’au moins 3 maladies chroniques.
Figure 2 – Réduction des taux d’utilisation des antibiotiques par rapport à la période pré-pandémique, selon le nombre de maladies chroniques et le groupe d’âge (Québec, %)
Le choix des antibiotiques prescrits concorde généralement avec les recommandations provinciales, mais leurs dosages pas autant
| GROUPE | Concordance du choix de l'antibiotique avec les guides cliniques | Influence des maladies chroniques | Concordance avec dosage | Tendance dans le temps |
|---|---|---|---|---|
| ENFANTS | Généralement > 90 % | Peu d'effet (écarts non significatifs) | Non mesurée | Pas d’impact visible de la pandémie |
| ADULTES | Généralement > 80 % | Diminution avec plus de maladies chroniques | 21 % à 79 %, varie selon le type d’infection | Amélioration graduelle pour rhino-sinusites et infections urinaires, l'impact de la pandémie ne ressort pas |
Figure 3 – Proportion d’ordonnances concordant avec les recommandations des guides cliniques, par infection et groupe d’âge, nombre de maladies chroniques et année (Québec, avril 2018 à mars 2022)
Chez les enfants
Chez les adultes
La surveillance de la présence de gènes de résistance dans les eaux usées complète le portrait de l’antibiorésistance dans la population générale en documentant l’association entre l’utilisation et la résistance
L’utilisation communautaire d’antibiotiques corrélait bien avec la concentration de gènes de résistance dans les eaux des deux stations de traitement des eaux usées les plus grandes sur les trois stations participantes (les résultats d’une de ces deux stations sont présentés à la figure 4); la population desservie par la troisième station était plus petite, ce qui pourrait expliquer l’absence de corrélation.
Figure 4 - Relation entre le nombre de prescriptions d’antibiotiques réclamées (β-lactamines, fluoroquinolones, macrolides) et l’abondance relative des gènes de résistance dans les eaux usées (station d'épuration ciblée)
Conclusion
L’utilisation communautaire des antibiotiques a diminué pendant la pandémie et n’avait pas encore retrouvé les niveaux prépandémiques en mars 2022 malgré une remontée de l’utilisation vers la fin de la période étudiée. Ces tendances ont également été observées ailleurs (Ventura-Gabarró 2023; Mamun 2021; Kitano 2021). L’arrêt, puis la reprise de la circulation des virus respiratoires habituels est une explication plausible des tendances observées.
Pour la majorité des infections, le respect des guides cliniques provinciaux diminue avec le cumul de maladies chroniques chez les patients adultes, ce qui peut s’expliquer en partie par un évitement d’interactions entre la médication régulière et l’antibiotique (Wang 2019; HSE 2025). La pandémie de COVID-19 ne semble pas avoir eu d’impact quant au respect des guides cliniques. On remarque toutefois une adoption graduelle des dosages recommandés dans le traitement de plusieurs infections, depuis la publication des nouveaux guides, en 2016-2017.
La surveillance de l’antibiorésistance dans les eaux usées semble prometteuse pour compléter un portrait de la circulation des gènes de résistance dans la population générale. Toutefois, les données disponibles sur les eaux usées n’ont pas permis de quantifier l’impact de l’importante diminution de l’utilisation des antibiotiques pendant la pandémie sur la résistance dans la flore intestinale de la population générale. Il demeure pertinent de répondre à cette question, soit de déterminer s’il est possible de réduire la fréquence de la résistance aux antibiotiques dans la population générale en réduisant l’utilisation communautaire. Cela permettrait de fixer des objectifs aux interventions de santé publique contre l’antibiorésistance.
Notes méthodologiques
Ce projet présente des résultats fondés en partie sur des données obtenues sous licence d’IQVIA Solutions Canada Inc.: Geographic Prescription Monitor pour la période de janvier 2019 à mai 2023. Tous droits réservés. Les déclarations, résultats, conclusions, et opinions contenus et exprimés ici sont ceux des auteurs et ne reflètent pas nécessairement ceux d’IQVIA Solutions Canada Inc. ou de l’une de ses entités affiliées ou filiales.
Ce projet intègre trois études distinctes, décrites dans le tableau ci-dessous.
| Impact conjoint de la pandémie et des maladies chroniques sur les taux d’utilisation des antibiotiques | Impact conjoint de la pandémie et des maladies chroniques sur la concordance avec les guides cliniques en antibiothérapie (à paraître) | Corrélation entre les taux d’utilisation des antibiotiques et l’antibiorésistance dans les eaux usées | |
| POPULATIONS | Individus couverts par le régime public d’assurance médicaments (RPAM) (au moins une journée) | Ordonnances d’antibiotiques servies à des individus couverts par le RPAM et ayant consulté dans les 2 jours précédant le service en pharmacie pour une infection couverte par un guide clinique de l’Institut national d’excellence en santé et en services sociaux (INESSS) | Résidents des territoires desservis par les 3 stations de traitement des eaux usées |
| PÉRIODE | 1er avril 2018 - 31 mars 2022 | 1er avril 2018 - 31 mars 2022 | Septembre 2020 - septembre 2022 *Prélèvements lors de mois sélectionnés :
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| SOURCES DE DONNÉES | Système intégré de surveillance des maladies chroniques du Québec (SISMACQ) | SISMACQ Guides cliniques en antibiothérapie de l’INESSS, en vigueur en 2018, contre :
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| ISSUE | Taux d’utilisation des antibiotiques en nombre d’ordonnances par 1000 individus-jours Antibiotiques systémiques (classe ATC J01) seulement | Pour chaque type d’infection, en séparant enfants et adultes :
| Abondance relative des gènes de résistance suivants :
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| DÉTERMINANTS À L’ÉTUDE | Nombre de maladies chroniques (0, 1, 2, ≥3, sur une possibilité de 31) Période
Reprise de la circulation des autres virus respiratoires (août 2021 – mars 2022) | Nombre de maladies chroniques (0, 1, 2, ≥3, sur une possibilité de 31) Période
Reprise de la circulation des autres virus respiratoires (août 2021 – mars 2022)
| Taux d’utilisation des antibiotiques, en ordonnances par 1000 habitants |
| VARIABLES D’AJUSTEMENT OU DE STRATIFICATION | Grand groupe d’âge (0-17 ans, 18-64 ans, 65 ans ou plus) Groupe d’âge plus fin (0-1, 2-4, 5-9, 10-17, 18-29, 30-39, 40-49, 50-64, 65-69, 70-79 et 80 ans ou plus) Mois, année Sexe Résidence en milieu urbain ou rural Quintiles des indices de défavorisation matérielle et sociale | Enfants ou adultes Groupe d’âge plus fin (0-1, 2-4, 5-11, 12-17, 18-29, 30-49, 50-64, 65-74 et 75 ans ou plus) Mois, année Sexe Résidence en milieu urbain ou rural Quintiles des indices de défavorisation matérielle et sociale | Secteur desservi par chaque station de traitement des eaux usées Classe d’antibiotiques (β-lactamines, macrolides, fluoroquinolones) Mois, année |
| ANALYSES STATISTIQUES | Séries temporelles des taux par mois, selon le groupe d’âge et le nombre de maladies chroniques Régressions de Poisson ajustées, utilisant des équations d’estimation généralisées | Séries temporelles de la proportion de concordance par année et par infection, selon le groupe d’âge et le nombre de maladies chroniques Régressions de Poisson robuste ajustées, utilisant des équations d’estimation généralisées | Coefficients de corrélation de Spearman, appliquant une fonction de bootstrap pour estimer les intervalles de confiance
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| LIMITES À L’INTERPRÉTATION | Le nombre d’ordonnances peut être surestimé lorsqu’elles sont exécutées en plusieurs services (par exemple, intégrées en partie à des piluliers) Ne couvre que la population couverte par le RPAM (plus de 90 % des ≥65 ans, 30 à 40 % du reste de la population) | Pas d’information sur le mode de consultation (par exemple, téléconsultation) Imputation du type d’infection en fonction du délai entre la consultation et l’exécution de l’ordonnance Sous-estimation des dosages réellement prescrits lorsque le patient a été hospitalisé avant de compléter son traitement dans la communauté Ne couvre que la population couverte par le RPAM | La période étudiée capte la période suivant la pandémie Analyse de corrélation qui ne permet pas de conclure sur d’éventuels liens de causalité, mais peut mettre en évidence un lien connu |
Pour en savoir plus
- Leal HF, Fortin É, Dorner S, Frigon D, Quach C, Bédard É. Influence of antimicrobial consumption (AMC) on the detection of antimicrobial resistance genes (ARGs) in urban wastewater. Int J Hyg Environ Health. 2025;268:114621.
- Guides d’usage optimal. Institut national d’excellence en santé et services sociaux, Québec, https://www.inesss.qc.ca/formations-et-outils/outils-cliniques/outils-par-types/guides-dusage-optimal.html (consulté le 11 octobre 2024). Cette page internet présente les guides cliniques en vigueur en ce moment; les guides cliniques utilisés pour la deuxième étude, soient ceux de 2016-2017, peuvent être obtenus auprès de la première auteure, sur demande.
- Simard M, Sirois C, Candas B. Validation of the Combined Comorbidity Index of Charlson and Elixhauser to Predict 30-Day Mortality Across ICD-9 and ICD-10. Med Care. 2018 May;56(5):441-447.
- Ventura-Gabarró C, Leung VH, Vlahović-Palčevski V, et al. Rebound in community antibiotic consumption after the observed decrease during the COVID-19 pandemic, EU/EEA, 2022. Euro Surveill. 2023;28(46):pii=2300604.
- Mamun AA, Saatchi A, Xie M, et al. Community Antibiotic Use at the Population Level During the SARS-CoV-2 Pandemic in British Columbia, Canada. Open Forum Infect Dis 2021;8(6):ofab185.
- Kitano T, Brown KA, Daneman N, et al. The Impact of COVID-19 on Outpatient Antibiotic Prescriptions in Ontario, Canada; An Interrupted Time Series Analysis. Open Forum Infect Dis 2021;8(11):ofab533.
- Wang Y, Bahar MA, Jansen AME, et al. Improving antibacterial prescribing safety in the management of COPD exacerbations: systematic review of observational and clinical studies on potential drug interactions associated with frequently prescribed antibacterials among COPD patients. J Antimicrob Chemother. 1 oct 2019;74(10):2848‑64.
- Drug Interactions. Health Service Executive, Dublin, https://www.hse.ie/eng/services/list/2/gp/antibiotic-prescribing/drug-i… (consulté le 21 mars 2025).
- Fortin P, Fortin É, Sirois C, Quach C, Simard M, Magali-Ufitinema N, Sauvageau C. (2025). The combined impact of the COVID-19 pandemic and the number of comorbidities on community antibiotic utilization rates: a population-based retrospective cohort study using linked health administrative data in Quebec, Canada. BMJ Open.
Autrices et auteurs
Élise Fortin, Patrick Fortin, Chantal Sauvageau et Philip Verret, Direction des risques biologiques, INSPQ
Véronique Boiteau, Marc Simard et Caroline Sirois, Bureau d’information et d’études en santé des populations, INSPQ
Helena Leal, Université de Montréal et stagiaire, INSPQ
Caroline Quach, Université de Montréal
Émilie Bédard, Polytechnique Montréal
Nadine Magali-Ufitinema, Ministère de la Santé et des Services sociaux
Collaboration
Karl Forest-Bérard, conseiller scientifique, et Delphine Descamps, webmestre.
Financement
Les travaux sur la corrélation entre l’utilisation des antibiotiques et la résistance dans les eaux usées ont été menés par l’équipe de l’Université de Montréal et ont bénéficié de trois subventions soutenues par les Fonds de recherche du Québec :
- Programme de bourses d'excellence pour étudiants étrangers
- Fonds d’amorçage de CentrEau (Centre québécois de recherche sur la gestion de l'eau)
- VITAM - Centre de recherche en santé durable
Le reste du projet a été financé par le ministère de la Santé et des Services sociaux.